Havza Planlama ve Arazi Islahı Daire Başkanlığının görevleri şunlardır;

1- Toprağın korunması, tabii kaynakların geliştirilmesi ve iklim değişikliği ile mücadele maksadıyla; havza bütünlüğü esas alınarak entegre havza ıslahı plan ve projelerini yapmak, yaptırmak, bu plan ve projelerin gerektirdiği etüt ve proje işlerini yürütmek, projeleri uygulamak, uygulanmasını izlemek, kurumlara proje desteği sağlamak, bu iş ve işlemlerle ilgili politika ve stratejilerin belirlenmesi maksadıyla ilgili kurum ve kuruluşlar arasında işbirliği ve koordinasyon sağlamak.

2- Çölleşme ve erozyonla mücadele çalışmaları için ülke genelinde ve havza bazında potansiyel çalışma alanlarını ve öncelikleri belirlemek.

3- Havzada yapılan faaliyetlerin çölleşme ve erozyona olan etkileri ile ilgili çalışmaları yapmak ve yaptırmak.

4- Genel Müdürlüğün görev alanı ile ilgili olarak uzaktan algılama ve coğrafi bilgi sistemi faaliyetlerini yürütmek,  projelerle alakalı veri tabanları hazırlamak.

5- Havzalarda arazi kullanım durumunu, bitki örtüsündeki değişimi izlemek, değerlendirmek ve raporlamak.

6- Su havzalarının geliştirilmesine yönelik ulusal ve bölgesel düzeyde planlama yapmak, politika ve stratejilerin belirlenmesi maksadıyla çalışmalar yapmak.

7- Çölleşme ve erozyonla mücadele ile iklim ve çevre amaçlı kullanıma uygun uydu gönderimi veya uydu verilerinin teminine ilişkin iş ve işlemleri yürütmek,

8- Genel Müdür tarafından verilen benzeri görevleri yapmak.